Instalación de Entorno de trabajo. UV

Ingeniería Biomédica

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Escalabilidad y Reproducibilidad

Para asegurar la escalabilidad y la reproducibilidad en proyectos de procesamiento de señales e IA, la integración de módulos desde una carpeta src/ hacia un punto de entrada raíz (main.py) debe seguir estándares de desarrollo Senior. En este documento se detalla la configuración técnica requerida utilizando uv.

1. Definición de Paquetes mediante __init__.py

En arquitecturas profesionales, cada subdirectorio dentro de src/ debe ser tratado como un paquete. Aunque Python 3.3+ permite Namespace Packages, la inclusión explícita de archivos __init__.py es la norma en desarrollo robusto para delimitar el alcance de los módulos.

Su estructura debe consolidarse de la siguiente manera:

.
├── src/
│   ├── __init__.py
│   ├── features/
│   │   ├── __init__.py
│   │   └── extraction.py
│   ├── preprocessing/
│   │   ├── __init__.py
│   │   └── filters.py
│   └── models/
│       ├── __init__.py
│       └── causal_ia.py
├── main.py
└── pyproject.toml

2. Sintaxis de Importación en main.py

Dado que main.py se encuentra en la raíz, Python añade este directorio al sys.path automáticamente. La forma correcta de acceder a la lógica de procesamiento es mediante importaciones absolutas.

# Ejemplo de implementación en main.py
from src.preprocessing.filters import butterworth_filter
from src.features.extraction import compute_emg_rms
from src.models.causal_ia import structural_model_fit

def main():
    """
    Pipeline principal para el análisis de señales de espasticidad.
    """
    # Ejemplo de aplicación de un filtro digital: H(z)
    print("Iniciando procesamiento de señales...")
    # ... lógica del programa ...

if __name__ == "__main__":
    main()

3. Configuración del Entorno con uv

Para evitar errores de tipo ModuleNotFoundError, el proyecto debe ser instalado en modo editable dentro del entorno virtual. Esto permite que el gestor de paquetes reconozca la carpeta src como una fuente legítima de módulos instalados.

Configuración de pyproject.toml

Ajuste su archivo de configuración para declarar el sistema de construcción y los paquetes incluidos:

[build-system]
requires = ["hatchling"]
build-backend = "hatchling.build"

[project]
name = "spasticity-signal-analysis"
version = "0.1.0"
dependencies = [
    "numpy",
    "scipy",
    # Agregue sus dependencias de IA aquí
]

[tool.hatch.build.targets.wheel]
packages = ["src"]

Ejecución de la Instalación Editable

Desde la terminal, ejecute el siguiente comando para que uv gestione el enlace simbólico:

uv pip install -e .

Esto garantiza que cualquier cambio realizado en los scripts dentro de src/ se refleje inmediatamente en main.py sin necesidad de reinstalación.

4. Consideraciones Críticas y Errores Comunes

ImportanteEvite el uso de sys.path.append()

Es una práctica deficiente que compromete la portabilidad del código. La resolución de rutas debe ser gestionada por el entorno de ejecución o el sistema de empaquetado.

AdvertenciaImportaciones Relativas

No intente usar from .src import ... en main.py. Las importaciones relativas solo son válidas dentro de paquetes definidos, no en scripts de ejecución principal (top-level scripts).

Uso de UV

Ejemplos de uso

Solución de problemas